MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 plasmid A

Total Repeats: 617

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007483	GTG	2	6	371	376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163518
2	NC_007483	GCC	2	6	477	482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
3	NC_007483	TCCTGC	2	12	563	574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	77163518
4	NC_007483	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
5	NC_007483	GCC	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163518
6	NC_007483	CAT	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163518
7	NC_007483	CCA	2	6	825	830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163518
8	NC_007483	GTA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163518
9	NC_007483	TGCT	2	8	869	876	0 %	50 %	25 %	25 %	77163518
10	NC_007483	TCGG	2	8	886	893	0 %	25 %	50 %	25 %	77163518
11	NC_007483	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163518
12	NC_007483	GCC	2	6	1180	1185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
13	NC_007483	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163519
14	NC_007483	TCA	2	6	1229	1234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163519
15	NC_007483	CCT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
16	NC_007483	ATAC	2	8	1421	1428	50 %	25 %	0 %	25 %	77163519
17	NC_007483	GCC	2	6	1468	1473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163519
18	NC_007483	CAGC	2	8	1519	1526	25 %	0 %	25 %	50 %	77163519
19	NC_007483	CCT	3	9	1574	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163519
20	NC_007483	TTG	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
21	NC_007483	GTT	2	6	1592	1597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163519
22	NC_007483	CCA	2	6	2263	2268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163520
23	NC_007483	TTCC	2	8	2419	2426	0 %	50 %	0 %	50 %	77163520
24	NC_007483	GCCA	2	8	2505	2512	25 %	0 %	25 %	50 %	77163520
25	NC_007483	AATTT	2	10	2556	2565	40 %	60 %	0 %	0 %	77163520
26	NC_007483	CT	3	6	2572	2577	0 %	50 %	0 %	50 %	77163521
27	NC_007483	TCTTA	2	10	2586	2595	20 %	60 %	0 %	20 %	77163521
28	NC_007483	CCT	2	6	2846	2851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163522
29	NC_007483	CCAGA	2	10	2875	2884	40 %	0 %	20 %	40 %	77163522
30	NC_007483	CGG	2	6	2925	2930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
31	NC_007483	AAC	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
32	NC_007483	CG	3	6	3014	3019	0 %	0 %	50 %	50 %	77163522
33	NC_007483	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	77163522
34	NC_007483	ACC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
35	NC_007483	ACT	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163522
36	NC_007483	GAA	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
37	NC_007483	ACC	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
38	NC_007483	ACC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
39	NC_007483	CGG	2	6	3234	3239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
40	NC_007483	GGC	2	6	3255	3260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
41	NC_007483	GCA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
42	NC_007483	GCA	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
43	NC_007483	GCA	2	6	3324	3329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
44	NC_007483	ACC	2	6	3334	3339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
45	NC_007483	AGC	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163522
46	NC_007483	GCCA	2	8	3351	3358	25 %	0 %	25 %	50 %	77163522
47	NC_007483	GGC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
48	NC_007483	AGCG	2	8	3406	3413	25 %	0 %	50 %	25 %	77163522
49	NC_007483	CGCCAC	2	12	3420	3431	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	77163522
50	NC_007483	GGCGA	2	10	3499	3508	20 %	0 %	60 %	20 %	77163522
51	NC_007483	AC	3	6	3643	3648	50 %	0 %	0 %	50 %	77163522
52	NC_007483	AACA	2	8	3674	3681	75 %	0 %	0 %	25 %	77163522
53	NC_007483	ACC	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163522
54	NC_007483	CACGC	2	10	3724	3733	20 %	0 %	20 %	60 %	77163522
55	NC_007483	GAA	2	6	3783	3788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163522
56	NC_007483	GAAAC	2	10	3795	3804	60 %	0 %	20 %	20 %	77163522
57	NC_007483	AAC	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163522
58	NC_007483	AGG	2	6	3886	3891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163522
59	NC_007483	GC	3	6	3900	3905	0 %	0 %	50 %	50 %	77163522
60	NC_007483	CGG	2	6	3913	3918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
61	NC_007483	G	6	6	3920	3925	0 %	0 %	100 %	0 %	77163522
62	NC_007483	CGG	2	6	3927	3932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163522
63	NC_007483	GCAA	2	8	3963	3970	50 %	0 %	25 %	25 %	77163522
64	NC_007483	GCC	2	6	3999	4004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163522
65	NC_007483	ACT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163523
66	NC_007483	GAA	2	6	4679	4684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163523
67	NC_007483	CGC	2	6	4736	4741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163523
68	NC_007483	ATA	2	6	4913	4918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163524
69	NC_007483	TGC	2	6	4930	4935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
70	NC_007483	CCT	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163524
71	NC_007483	AGC	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163524
72	NC_007483	CTG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163524
73	NC_007483	GGAG	2	8	5102	5109	25 %	0 %	75 %	0 %	77163524
74	NC_007483	TGA	2	6	5143	5148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163524
75	NC_007483	TACTC	2	10	5176	5185	20 %	40 %	0 %	40 %	77163524
76	NC_007483	GAG	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163524
77	NC_007483	CCG	2	6	5490	5495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
78	NC_007483	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163525
79	NC_007483	AAT	2	6	5768	5773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
80	NC_007483	CAC	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
81	NC_007483	AGCT	2	8	5900	5907	25 %	25 %	25 %	25 %	77163525
82	NC_007483	CGAT	2	8	5937	5944	25 %	25 %	25 %	25 %	77163525
83	NC_007483	CGGT	2	8	5972	5979	0 %	25 %	50 %	25 %	77163525
84	NC_007483	ACC	2	6	6123	6128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163525
85	NC_007483	TCA	2	6	6171	6176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163525
86	NC_007483	GCT	2	6	6178	6183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
87	NC_007483	TCTG	2	8	6264	6271	0 %	50 %	25 %	25 %	77163525
88	NC_007483	TGC	2	6	6278	6283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163525
89	NC_007483	GCC	2	6	6332	6337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
90	NC_007483	CTT	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163525
91	NC_007483	CCT	2	6	6496	6501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163525
92	NC_007483	CCG	2	6	6532	6537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163525
93	NC_007483	AGAAAA	2	12	6627	6638	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	77163525
94	NC_007483	A	6	6	6635	6640	100 %	0 %	0 %	0 %	77163525
95	NC_007483	TAA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
96	NC_007483	ATA	2	6	6663	6668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163525
97	NC_007483	AAC	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163526
98	NC_007483	CAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
99	NC_007483	CAG	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163526
100	NC_007483	GCT	2	6	6985	6990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
101	NC_007483	GTC	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163526
102	NC_007483	AG	3	6	7110	7115	50 %	0 %	50 %	0 %	77163526
103	NC_007483	GCTGA	2	10	7144	7153	20 %	20 %	40 %	20 %	77163526
104	NC_007483	CTC	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
105	NC_007483	CCT	3	9	7178	7186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163526
106	NC_007483	CGC	2	6	7197	7202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163526
107	NC_007483	TGA	2	6	7205	7210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163526
108	NC_007483	A	6	6	7219	7224	100 %	0 %	0 %	0 %	77163526
109	NC_007483	AT	3	6	7303	7308	50 %	50 %	0 %	0 %	77163527
110	NC_007483	TGG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163527
111	NC_007483	GGCA	2	8	7387	7394	25 %	0 %	50 %	25 %	77163527
112	NC_007483	TGA	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163527
113	NC_007483	GATTC	2	10	7583	7592	20 %	40 %	20 %	20 %	77163527
114	NC_007483	CGG	2	6	7640	7645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163527
115	NC_007483	GAA	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163527
116	NC_007483	AGG	2	6	7669	7674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163527
117	NC_007483	ACG	2	6	7708	7713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163527
118	NC_007483	GTG	2	6	7796	7801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163527
119	NC_007483	GCT	2	6	7909	7914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163527
120	NC_007483	GGA	2	6	8049	8054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163527
121	NC_007483	A	6	6	8063	8068	100 %	0 %	0 %	0 %	77163527
122	NC_007483	TTA	2	6	8205	8210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163528
123	NC_007483	T	6	6	8239	8244	0 %	100 %	0 %	0 %	77163528
124	NC_007483	CTG	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163528
125	NC_007483	CTT	2	6	8333	8338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163528
126	NC_007483	AGC	2	6	8384	8389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163528
127	NC_007483	CCA	2	6	8427	8432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163528
128	NC_007483	GCCG	2	8	8441	8448	0 %	0 %	50 %	50 %	77163528
129	NC_007483	AGT	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163528
130	NC_007483	CGG	2	6	8544	8549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163528
131	NC_007483	AGC	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163528
132	NC_007483	TC	3	6	8590	8595	0 %	50 %	0 %	50 %	77163528
133	NC_007483	TTG	2	6	8618	8623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163528
134	NC_007483	GAA	2	6	8677	8682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163528
135	NC_007483	GGA	2	6	8857	8862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163528
136	NC_007483	ATT	2	6	8898	8903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163528
137	NC_007483	T	7	7	8902	8908	0 %	100 %	0 %	0 %	77163529
138	NC_007483	GAT	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163529
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142	NC_007483	CTT	2	6	9062	9067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163529
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254	NC_007483	CAG	2	6	16292	16297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163536
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258	NC_007483	TCA	2	6	16362	16367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163536
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260	NC_007483	TCC	2	6	16535	16540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	77163536
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262	NC_007483	ATC	2	6	16584	16589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163536
263	NC_007483	AGC	2	6	16597	16602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163536
264	NC_007483	AGAAC	2	10	16615	16624	60 %	0 %	20 %	20 %	77163536
265	NC_007483	TAAAGA	2	12	16675	16686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	77163536
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267	NC_007483	CCG	2	6	16986	16991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163537
268	NC_007483	CCAG	2	8	17045	17052	25 %	0 %	25 %	50 %	77163537
269	NC_007483	CG	3	6	17069	17074	0 %	0 %	50 %	50 %	77163537
270	NC_007483	CCTG	2	8	17085	17092	0 %	25 %	25 %	50 %	77163537
271	NC_007483	CTT	2	6	17158	17163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163537
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281	NC_007483	CCG	2	6	17625	17630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	77163537
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380	NC_007483	CGG	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77163545
381	NC_007483	ACA	2	6	24774	24779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163545
382	NC_007483	GAT	3	9	24814	24822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163545
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384	NC_007483	CAT	2	6	24943	24948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163545
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392	NC_007483	GA	3	6	25458	25463	50 %	0 %	50 %	0 %	77163545
393	NC_007483	CGA	2	6	25474	25479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163545
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396	NC_007483	CGA	2	6	25599	25604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163545
397	NC_007483	CT	3	6	25606	25611	0 %	50 %	0 %	50 %	77163545
398	NC_007483	GTT	2	6	25645	25650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163545
399	NC_007483	TGT	2	6	25732	25737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163545
400	NC_007483	GCTG	2	8	25747	25754	0 %	25 %	50 %	25 %	77163545
401	NC_007483	AAG	2	6	25809	25814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163545
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497	NC_007483	CTT	2	6	32647	32652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163549
498	NC_007483	GGA	2	6	32685	32690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77163549
499	NC_007483	TACA	2	8	32714	32721	50 %	25 %	0 %	25 %	77163549
500	NC_007483	ATA	2	6	32879	32884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163549

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